Thunderbird speichert alle eingehenden E-Mails standardmäßig in einer einzigen Datei namens INBOX, dem Posteingang. Diese Datei wird, insbesondere durch Mails mit großen Anhängen, schnell sehr groß. Dadurch werden Lese- und Suchvorgänge in dieser Datei langsam. Dieser Effekt wird durch Anti-Viren-Software, die den Posteingang bei jeder Veränderung der Datei INBOX, also bei jedem Eingang einer neuen E-Mail, komplett neu überprüft, noch verstärkt.